Výhody frakční destilace skla jsou četné a praktické. Za prvé, skleněná konstrukce zajišťuje vynikající chemickou kompatibilitu, zabraňuje kontaminaci a umožňuje vysokou čistotu konečného výrobku. Za druhé, viditelnost sklářského přístroje umožňuje sledování procesu destilace v reálném čase, což je neocenitelné pro optimalizaci procesu a řešení problémů. Za třetí, skleněná frakční destilace je vysoce účinná, což umožňuje lepší oddělení směsí s blízkým varu ve srovnání s jednoduchou destilací. Kromě toho je snadnější čistit a udržovat, což snižuje dobu výpadku a provozní náklady. Tyto výhody se překládá do lepší kvality výrobku, zvýšené výnosnosti a nakonec větší spokojenosti zákazníků.